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los estafilococos coagulasa negativos (CoNS) constituyen una parte autóctona de la microbiota de la piel y mucosa humana y animal (1)., Durante un período de varias décadas, los contras y particularmente el Staphylococcus epidermidis han evolucionado como patógenos oportunistas importantes, causando principalmente infecciones relacionadas con la atención médica en pacientes con dispositivos médicos residentes (2, 3). Anteriormente, estas infecciones se consideraban predominantemente de origen endógeno, pero se han acumulado pruebas considerables que confirman que los genotipos nosocomiales de S. epidermidis colonizan a los pacientes y al personal sanitario y causan una proporción sustancial de infecciones asociadas a la atención sanitaria (4-11). S., la epidermidis es actualmente el principal patógeno en las infecciones del torrente sanguíneo relacionadas con el catéter y la sepsis neonatal de inicio temprano, y también es una causa frecuente de infecciones de las articulaciones protésicas, endocarditis de las válvulas protésicas y otras infecciones relacionadas con dispositivos biomédicos (12-15). Un desafío clínico importante es que estas infecciones a menudo son causadas por fenotipos de S. epidermidis multirresistentes y que las infecciones son de naturaleza crónica debido a la adherencia y la formación de biopelículas en dispositivos médicos residentes., Estos factores impiden la terapia antimicrobiana y, en última instancia, pueden requerir la eliminación de dispositivos biomédicos para eliminar las infecciones (2).

en comparación con lo que se ha observado para Staphylococcus aureus resistente a la meticilina (SARM), se sabe mucho menos sobre la epidemiología y la transmisión de S. epidermidis en entornos de atención médica, a pesar de que las cepas de S. epidermidis han sido reconocidas como patógenos nosocomiales significativos durante más de 30 años (2, 16). Esta negligencia puede ser atribuible a la ignorancia del alcance real del impacto de S. epidermidis en las infecciones relacionadas con la atención médica., En particular, las estimaciones de tal importancia clínica de los contras en el entorno de la atención médica difieren incluso entre los países del Norte de Europa (17, 18). La importancia de S. epidermidis como causa de infecciones asociadas al ganado ha sido recientemente objeto de investigación (19).

durante varios años, ha habido una falta de métodos simples y confiables para la identificación de especies, lo que ha dificultado la evaluación y comprensión de la epidemiología de S. epidermidis y la evaluación de bacterias de esta especie en cultivos clínicos. Varias características inherentes de S., las infecciones por epidermidis se suman a las dificultades para hacer un diagnóstico microbiano correcto y distinguir entre contaminación, colonización e infección verdadera. Tales características consisten en variación morfológica fenotípica, incluyendo Variantes de colonias pequeñas (SCVs) y diferentes antibiogramas (variabilidad clonal), así como infecciones policlonales e infecciones CoNS multiespecies (12, 20-22). Desafortunadamente, todas estas características de S., la infección por epidermidis puede aumentar la dificultad de evaluar los hallazgos del cultivo y, por lo tanto, aumentar el riesgo de que los resultados se descarten como debidos a la contaminación, lo que impide un diagnóstico y tratamiento microbianos adecuados. Estos problemas ocurren principalmente cuando S. epidermidis se evalúa en biopelículas y en infecciones relacionadas con el dispositivo., En los últimos años, la espectrometría de masas de tiempo de vuelo con ionización de desorción láser asistida por matriz (MALDI-TOF MS) ha revolucionado el diagnóstico microbiano de rutina, ya que este método tan esperado permite una identificación rápida y confiable a nivel de especie de alto rendimiento de aislados clínicos (23). MALDI-TOF MS contribuirá significativamente a mejorar la evaluación y el diagnóstico de las infecciones causadas por contras (24).

otro factor que ha limitado las investigaciones de la epidemiología de S. epidermidis es la falta de métodos de genotipado rápidos, no intensivos en mano de obra, altamente discriminatorios y reproducibles., La electroforesis en gel de campo pulsado se ha utilizado en estudios epidemiológicos a corto plazo, y la tipificación de secuencias multilocus (MLST) ha aportado datos inequívocos y altamente reproducibles que reflejan las relaciones evolutivas a largo plazo entre los aislados (6, 25, 26). Sin embargo, ambos métodos son laboriosos y requieren mucho tiempo, y el poder discriminatorio de MLST es insuficiente para el uso rutinario en investigaciones de brotes de genotipos de S. epidermidis asociados a la atención médica debido a la gran proporción de aislados de secuencia tipo 2 (6, 11).,

a la luz de los desafíos actuales que enfrenta la microbiología clínica y los profesionales que abordan el control de enfermedades infecciosas, el artículo exhaustivo de Tolo y colegas incluido en este número de Journal of Clinical Microbiology presenta un método interesante para simplificar la identificación de genotipos de S. epidermidis en el entorno clínico (27)., Mediante el análisis de siete polimorfismos de nucleótido único (SNPs), estos investigadores fueron capaces de asignar con precisión 545 (94%) de 578 tipos de secuencia a seis grupos genéticos (GCs), que se hipotetizaron para reflejar tres fuentes diferentes de aislados: aislados de sangre que representan la infección verdadera, aislados de sangre que representan contaminantes, y aislados de transporte de fuentes no hospitalarias. Equivalente al uso de un panel de cinco marcadores genéticos bien estudiados (icaA, IS256, sesD , mecA y arginina elemento móvil catabólico), la tipificación por GC podría diferenciar aislamientos hospitalarios de aislados no hospitalarios con una precisión del 80%., Sin embargo, y no es sorprendente, ninguno de estos métodos podría discriminar adecuadamente entre los aislados de S. epidermidis de la infección y las fuentes de contaminantes. Esto se puede atribuir al hallazgo de que la colonización a menudo precede a la infección, lo que hace que un método basado en datos de MLST no pueda distinguir entre los aislados hospitalarios que causan infecciones y aquellos identificados únicamente como contaminantes (26, 28).

otro resultado importante y explicativo reportado por Tolo et al., es que el uso de la morfología de la colonia es insuficiente como base para distinguir los contaminantes de los aislados de infección del mismo paciente, como es práctica común en algunos laboratorios de Microbiología. También es imperativo analizar los genomas de varios aislados de CoNS de un cultivo clínico para comprender y evaluar más plenamente los desafíos mencionados anteriormente asociados con la evaluación clínica de los hallazgos de CoNS (que incluyen, entre otros, los SCVs, la infección policlonal y las infecciones de CoNS multiespecies)., Además, para dilucidar la evolución del genoma dentro de un huésped y reconstruir los eventos de transmisión, será esencial analizar varios aislados de cada paciente mediante el uso de la secuenciación del genoma completo (WGS) (29). En el futuro, el WGS se utilizará sin duda como un método de genotipado de primera línea que puede proporcionar datos rápidos y completamente inequívocos con resolución final, así como información sobre la cadena de transmisión y la presencia de factores de virulencia, resistencia genotípica antimicrobiana y elementos genéticos móviles (30).,

en la actualidad, los métodos de secuenciación de próxima generación (NGS) siguen siendo demasiado complejos para su aplicación en la práctica diaria rutinaria en los laboratorios de microbiología clínica para su uso a gran escala en investigaciones y vigilancia de brotes (26). El rápido desarrollo actual del análisis de NGS probablemente conducirá a una mayor conciencia de S. epidermidis como un patógeno clínicamente relevante y resistente. Los métodos NGS también pueden ayudar a explicar la diseminación de S., las cepas de epidermidis y su función como reservorio de genes transferibles que pueden aumentar la virulencia y la resistencia de otros patógenos en entornos de atención de la salud, así como en la producción ganadera.

el estudio de Tolo et al. representa un paso importante para mejorar la evaluación del cultivo de S. epidermidis en los laboratorios de microbiología clínica, lo que puede proporcionar una mejor información a los médicos y, por lo tanto, darles un marco para una comprensión más completa del cuadro clínico de las infecciones por S. epidermidis asociadas a la atención de la salud., Este conocimiento también facilitará la extracción de conclusiones de estudios epidemiológicos e investigaciones de brotes y ayudará a evaluar el impacto de las medidas destinadas a reducir la propagación de la S. epidermidis multirresistente y las infecciones resultantes en el entorno sanitario.