xmlns=”http://www.rsc.org/schema/rscart38″>La membrana cellulare è costituito da una rete di glycoconjugates tra glicoproteine e glicolipidi che presenta una fitta matrice di carboidrati a giocare un ruolo fondamentale in molti processi biologici. La tecnologia a base di lectina è stata ampiamente utilizzata per caratterizzare i glicoconiugati nei tessuti e nelle linee cellulari., Tuttavia, la loro specificità verso il loro presunto ligando glicano e la sensibilità in situ sono stati tecnologicamente difficili da studiare. Inoltre, poiché riconoscono principalmente i glicani, gli obiettivi glicoproteici sottostanti non sono generalmente noti. In questo studio, abbiamo impiegato l’etichettatura ossidativa di prossimità della lectina (Lectina PROXL) per identificare le glicoproteine di superficie cellulare che contengono glicani riconosciuti dalle lectine. Le lectine comunemente usate sono state modificate con una sonda per produrre radicali idrossido in prossimità delle lectine etichettate., I polipeptidi sottostanti delle glicoproteine riconosciute dalle lectine sono ossidati e identificati dal flusso di lavoro proteomico standard. Di conseguenza, circa il 70% delle glicoproteine identificate è stato ossidato in situ da tutte le sonde di lectina, mentre solo il 5% delle proteine totali è stato ossidato. La correlazione tra i glicositi e i siti di ossidazione ha dimostrato l’efficacia delle sonde di lectina. La specificità e la sensibilità di ciascuna lectina sono state determinate utilizzando informazioni glicane site-specific ottenute attraverso analisi glicomiche e glicoproteomiche., In particolare, le lectine che legano l’acido sialico e le lectine che legano il fucosio avevano una maggiore specificità e sensibilità rispetto ad altre lectine, mentre quelle che erano specifiche per gli alti glicani di mannosio hanno scarsa sensibilità e specificità. Questo metodo offre una visione senza precedenti delle interazioni delle lectine con le glicoproteine specifiche come pure le reti della proteina che sono mediate dai tipi specifici del glycan sulle membrane cellulari.
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