Riarrangiamenti e traslocazioni di geni IG e TCR di Interlocutus

Non solo i geni IG e TCR subiscono riarrangiamenti intralocus, ma la loro ricombinazione aberrante causa anche traslocazioni e inversioni cromosomiche di interlocutus. Questi riarrangiamenti cromosomici possono creare geni ibridi del recettore dell’antigene quando due diversi loci del recettore dell’antigene si ricombinano tra loro. Una piccola frazione di ALL pediatrici del lignaggio delle cellule B o T ospita questi riarrangiamenti ibridi del gene del recettore dell’antigene.,336 In alternativa, i riarrangiamenti cromosomici possono giustapporre geni non-IG/non–TCR che inducono la trasformazione con gli elementi regolatori enhancer e promoter dei geni IG o TCR come secondo tipo di riarrangiamento dell’interlocutore. V (D)J errori di ricombinazione di questo tipo,337 causando upregulation trascrizionale dei geni non–IG/non–TCR giustapposti, si verificano in sottoinsiemi di pediatric ALL, specialmente in T-cell All.

I riarrangiamenti SIL-SCL e le traslocazioni SCL che interrompono i geni TCR sono presenti in circa il 30% dei casi di cellule T complessivamente., Il gene SCL(TAL1) a banda cromosomica 1p34, che codifica un fattore di trascrizione elica-loop-elica di base (bHLH), è stato scoperto per la prima volta alla giunzione del punto di interruzione della traslocazione t(1;14) (p34;q11) che coinvolge il locus TCR alfa-delta in una leucemia a cellule staminali.338 Altre cellule T TUTTI i casi ospitano un diverso tipo di riarrangiamento SCL, in cui l’attività illegittima della ricombinasi V(D)J a sequenze di segnale simili alla ricombinasi in SCL e SIL (locus SCL-interrupting) crea una delezione interstiziale sul cromosoma 1p. Il riarrangiamento SIL-SCL causa una regolazione aberrante dell’espressione SCL da parte del promotore SIL.,339.340 La traslocazione t(1;3)(p34;p21), fondendo SCL e il gene del recettore non antigene TCTA, è mediata da un meccanismo simile di attività illegittima della ricombinasi V(D)J.341

In altre traslocazioni ricorrenti in TUTTE le cellule T, vari geni oncogenici del fattore di trascrizione come LMO1, LMO2, LYL1 e HOX11(TLX1) sono fusi in diversi loci TCR, portando all’espressione non programmata della proteina del fattore di trascrizione pertinente.72 traslocazioni LMO2 si verificano nel 10% al 20% delle cellule T ALL., Gli esperimenti di Microarray hanno dimostrato che i geni del fattore di trascrizione oncogenico possono essere sovraespressi nelle cellule T IN TUTTI i sottoinsiemi a stadi di maturazione distinti e sono marcatori prognostici, anche quando gli studi di cariotipo convenzionali non rivelano tali traslocazioni.342 Ad esempio, l’analisi del PESCE bicolore e un test PCR mediato dalla legatura hanno rivelato traslocazioni criptiche del gene HOX11(TLX1) con il locus TCRD nella maggior parte delle ALLS a cellule T in cui vi era un’alta espressione HOX11.,343 Questa scoperta è particolarmente intrigante perché l’espressione di alto livello HOX11 nelle cellule T è correlata a una prognosi favorevole.343 Inoltre, l’immunofenotipo corticale doppio positivo CD34−, CD1a+, CD4 8 ha suggerito che lo stadio immaturo β pre-αβ dell’arresto della maturazione è associato ad un’elevata espressione di HOX11.343 Questi risultati hanno dimostrato che la citogenetica molecolare può fornire valutazioni più sensibili e coerenti di TUTTI i meccanismi oncogeni rispetto al cariotipo convenzionale.,

L’esempio più recente identificato di una traslocazione ricorrente del gene TCR in TUTTE le cellule T è la traslocazione t(6;7)(q23;q34), che giustappone il gene C-MYB alla banda cromosomica 6q23 con il locus TCRB.344 Sebbene le posizioni subtelomeriche di TCRB e C-MYB impedissero il riconoscimento di questo riarrangiamento mediante cariotipo convenzionale, il riarrangiamento è facilmente rilevabile con metodi come FISH, Southern blotting o PCR.,344 La clonazione molecolare ha rivelato una sequenza simile all’epatamero adiacente al punto di interruzione della traslocazione nel gene C-MYB, coerente con l’attività illegittima della ricombinasi V(D)J come meccanismo di questa traslocazione. In questa traslocazione, il posizionamento di C-MYB in prossimità dell’elemento regolatore TCRB enhancer si traduce in un’espressione aberrante dell’allele C-MYB traslocato e in una firma di espressione genica coerente con l’upregulation di vari geni di proliferazione e mitosi.344 La traslocazione t(6; 7) è di interesse clinico perché l’età media dei pazienti è di soli 2 anni.,2 anni, 344 che è insolito perché T-cell ALL è altrimenti raro nei bambini piccoli. Questa traslocazione esemplifica l’importanza delle mutazioni cooperanti nella patogenesi pediatrica, poiché molti casi di cellule T TUTTE con traslocazione t(6;7) contengono anche mutazioni NOTCH1 e delezioni ARF CDNK2A p16.344 Espressione disregolata di C-MYB nella cellula T TUTTI i giovanissimi possono anche derivare da duplicazioni geniche, come dimostrato da analisi molecolari e di fibre di PESCE del numero di copie del gene C-MYB.,344 C-MYB è espresso ad alti livelli nel timo, ed è stato suggerito che la deregolamentazione C-MYB deriva da un’espressione sostenuta piuttosto che ectopica344; in questo senso, si differenzia da molti altri fattori di trascrizione oncogeni interrotti in TUTTE le cellule T.

Un’altra traslocazione di TUTTE le cellule T, t(7;9)(q34;q34.3), fonde TCRB al gene che codifica la proteina del recettore transmembrana NOTCH1, che regola la maturazione delle cellule T.,345 Si tratta di una traslocazione estremamente rara, che si verifica in meno dell ‘ 1% dei casi di TUTTE le cellule T; tuttavia, è stato dimostrato più recentemente che almeno il 50% dei casi di TUTTE le cellule T presenta mutazioni NOTCH1 intrageniche attivanti, compresi i casi con altre traslocazioni principali.346 Attivando mutazioni NOTCH1 che interessano il dominio eterodimerizzazione extracellulare (HD) risultato in attivazione ligando-indipendente, mentre quelli che interessano il dominio parassita intracellulare causare una maggiore stabilità della proteina., La proteina mutante NOTCH1 è un potenziale bersaglio terapeutico degli inibitori della gamma secretasi, che può bloccare la segnalazione mediata da NOTCH1 in TUTTE le cellule T.346 L’inibizione della segnalazione NOTCH1 da parte degli inibitori della gamma secretasi è associata alla sovraregolazione della proteina soppressore tumorale della fosfatasi e dell’omologo tensin (PTEN).Sebbene uno studio clinico di fase 1-2 sull’inibizione della gamma secretasi non abbia mostrato efficacia nella LLA delle cellule T, la resistenza ai farmaci osservata potrebbe essere attribuita in parte alla delezione del gene PTEN., PTEN inibisce la via PI3K-AKT e la perdita della funzione PTEN è associata all’attivazione AKT e ad un interruttore nella dipendenza da oncogene dal NOTCH1 al percorso di segnalazione AKT. Le analisi mutazionali PTEN hanno indicato che un sottoinsieme di cellule T ALL (8%) ospita mutazioni di questo gene alla diagnosi, indipendentemente o insieme a mutazioni NOTCH1 o, in alternativa, le mutazioni PTEN possono essere alterazioni secondarie associate alla progressione della malattia.,

Analogamente ai riarrangiamenti del gene TCR di interlocutus in TUTTE le cellule T, gli approcci molecolari sono stati rivelati anche in TUTTE le cellule B precursori e sono state identificate e caratterizzate nuove traslocazioni ricorrenti che giustappongono geni IG con geni oncogeni del fattore di trascrizione. Un esempio recente è il t (6;14)(p22.3;q32.22) che fonde la regione di giunzione del gene IGH con il gene che codifica ID4.,348 La traslocazione causa la sovraespressione del fattore di trascrizione ID4 bHLH ed è associata a un immunofenotipo delle cellule B del precursore comune CD19+, CD10+, HLADR+, TDT+, caratteristiche cliniche a basso rischio e prognosi favorevole.348 Questa traslocazione è spesso accompagnata da delezione dei geni cromosomici 9p, CDKNA e PAX5, suggerendo la cooperatività di queste alterazioni nella patogenesi di questa malattia.348 Un altro esempio di riarrangiamento del gene IGH è visto con il t(5;14), che si verifica in meno dell ‘ 1% dei casi di precursore B-cell All., Il t(5;14) pone il gene IL3 sotto controllo regolatorio trascrizionale del locus IGH, con conseguente caratteristica clinica caratteristica dell’eosinofilia periferica associata a questa traslocazione.72

Nella rara entità della leucemia di Burkitt, l’espressione del MYC oncogene viene alterata dalla traslocazione nell’IGH o, meno spesso, nel locus della catena leggera IGK o IG, ma la trasformazione oncogenica in uno stadio di sviluppo delle cellule B più maturo viene riflessa dall’espressione di IgM sulla superficie cellulare della leucemia.,

Un’altra area di interesse è stata l’applicazione di approcci molecolari per determinare le origini temporali di TUTTI i riarrangiamenti dei geni IG, TCR o fattore di trascrizione specifici. Gli studi di ALL nei gemelli monozigoti e gli studi di TUTTE le aberrazioni citogenetiche molecolari nelle macchie di sangue di Guthrie neonatali sono stati utili per indicare se vari sottotipi di ALL insorgono prima o dopo la nascita., Nel caso di T-cell ALL, ci sono prove recenti che la malattia non è iniziata in utero o che l’aberrazione clonale nella maggior parte dei casi è presente al di sotto della sensibilità di rilevamento della PCR al momento della nascita.349 Tuttavia, questi risultati sono in contrasto con i risultati basati sulla PCR sui riarrangiamenti del gene TCR in altri due studi, che erano coerenti con un’origine prenatale della LLA delle cellule T.,350.351 In uno dei tre casi di cellule T TUTTI con mutazione NOTCH1, la mutazione NOTCH1 è stata rilevabile nel DNA neonatale di Guthrie blood spot, mentre il riarrangiamento SIL-SCL nello stesso caso si è verificato più tardi come evento postnatale.352 Pertanto, TUTTI i riarrangiamenti dei geni IG e TCR specifici e / o alterazioni del fattore di trascrizione associate alla leucemia in almeno alcuni ALLS delle cellule T sono in eventi uterini, anche se la latenza alla malattia clinicamente evidente può essere prolungata. La maggior parte dei sottotipi di precursori B-cell TUTTI iniziano anche in utero (vedi più avanti).