aunque los luteranos se convirtieron en el grupo protestante más grande de Wisconsin, fueron lentos en encontrar solidaridad debido a la compleja red nacional y local de sínodos. Los primeros luteranos en Wisconsin vinieron directamente de Europa y fueron dominados por los Sínodos de Wisconsin y Missouri, el más conservador de los grupos, y el antiguo Sínodo Noruego. Entre 1870 y 1890, los luteranos de Wisconsin aumentaron en un 422 por ciento, lo que refleja el gran número de inmigrantes escandinavos y alemanes en la década de 1880., Los luteranos alemanes de Wisconsin estaban principalmente afiliados a uno de los cinco sínodos liderados por Alemania: en la década de 1880, del 80 al 90 por ciento eran miembros de los Sínodos de Wisconsin o Missouri.

Sínodo de Missouri: los primeros luteranos alemanes llegaron a Milwaukee en 1839 y organizaron la Primera Iglesia Luterana del Estado, la Iglesia Luterana de la Trinidad, en Freistadt (ahora parte de Mequon). Aquellos sin los recursos para mudarse al norte, se quedaron en Milwaukee y fundaron una segunda iglesia. Originalmente parte del Sínodo de Buffalo, estos primeros luteranos se volvieron a afiliar con el recién creado Sínodo de Missouri a finales de la década de 1840., El Sínodo de Missouri en Wisconsin estableció un seminario privado de maestros en Milwaukee en 1855 llamado Milwaukee Teachers ‘ College. El Sínodo de Missouri también fue fuerte en Watertown en la década de 1850.el nivel sureste de los condados surgió como el Centro de alcance temprano clave en Wisconsin, pero la inundación de inmigrantes alemanes sobrecargó al personal sinodal existente y llevó a muchas áreas del estado a ser cedidas a otros sínodos, como el Sínodo de Iowa. El establecimiento de un programa de Misiones Domésticas en 1873 ayudó al Sínodo de Missouri a coordinar sus esfuerzos para llegar a las comunidades periféricas de alemanes., El Sínodo de Missouri también comenzó a cooperar con el Sínodo de Wisconsin para capturar a la mayoría de los luteranos alemanes del estado a finales del siglo XIX. Los sínodos luteranos comenzaron una importante realineación a principios del siglo XX, ya que los Sínodos de Missouri y Wisconsin se volvieron más introvertidos y declinaron cualquier fusión con compañeros luteranos. El trabajo misionero también se hizo más institucional y se centró en la fundación de congregaciones regulares. El trabajo misionero entre los luteranos de habla inglesa permaneció limitado hasta finales del siglo XIX: la Primera Iglesia Luterana inglesa en Wisconsin fue fundada en Milwaukee en 1890.,

Sínodo de Wisconsin: el Sínodo de Wisconsin fue creado en 1850 y fue la primera organización Luterana en mantener el Centro de su trabajo en el estado. La mayoría de sus miembros provenían de los hijos de los colonos que habían llegado a Wisconsin en las décadas de 1830 y 1840; a diferencia de los Sínodos de Missouri y Buffalo, cuya membresía original derivaba de la migración planificada de miembros a Wisconsin. El Sínodo de Wisconsin dependió al principio de los clérigos de las sociedades misioneras en Alemania, pero construyó un seminario, Northwestern College, en Watertown en 1863 para entrenar a sus propios pastores., Los esfuerzos iniciales del Sínodo de Wisconsin se centraron en los condados del sureste. Comenzaron a organizar las comunidades rurales del Norte en la década de 1870. hasta el siglo 20, el Sínodo de Wisconsin limitó su trabajo a las comunidades de Habla Alemana y no se extendió mucho más allá de las fronteras de Wisconsin. En la década de 1980, el Sínodo de Wisconsin tenía miembros en 47 estados.

luteranos noruegos: sin la fuerza unificadora de la Iglesia Luterana Estatal de Noruega en los Estados Unidos, los inmigrantes noruegos dieron plena expresión a sus tendencias divergentes., En 1890, seis sínodos estaban compitiendo por las lealtades de la población inmigrante: la Iglesia Evangélica Luterana de América de 1846, el Sínodo noruego de 1853; el Sínodo Noruego Augustana de 1860, la Conferencia Noruego-danesa de 1860; el Sínodo de La Haya de 1876, y la Hermandad Anti-Missouriana de 1887. El noruego, conferencia y Haugean fueron los sínodos más dominantes en 1880. La mayoría de los grupos luteranos noruegos se concentraron en ministrar a otros noruegos y en construir congregaciones en las áreas que consideraban más prometedoras., En 1887, los Anti-Missourians, los augustanans Noruego-daneses, y la Conferencia se fusionaron en la Iglesia Luterana noruega Unida en América, superando al Sínodo noruego para convertirse en el cuerpo líder del luteranismo Noruego. La Iglesia Libre Luterana, un cuerpo predominantemente noruego, se formó en 1897 y contó con más de 6.000 miembros en 1926. Un pequeño grupo de luteranos de ascendencia noruega organizó la Iglesia de los hermanos luteranos en Milwaukee en 1900. Para 1900, los inmigrantes noruegos habían fundado no menos de 14 sínodos en los Estados Unidos., El 9 de junio de 1917, los tres sínodos principales se fusionaron para formar la Iglesia Luterana noruega en América, una unión que comprendía el 90 por ciento de los luteranos noruegos en el país., Tres de las instituciones luteranas más antiguas de la nación se originaron en Wisconsin: Luther College fue fundado en Halfway Creek en 1861 antes de mudarse a Decorah, Iowa en el año siguiente; la sección noruega del Seminario de Augsburgo se trasladó a Marshall en 1869 antes de mudarse a Beloit, Iowa en 1881 (es hoy Augustana College en Sioux Falls, SD); y el Seminario Teológico del Sínodo noruego se abrió en Madison en 1876 antes de reabrir en Minnesota en 1859 (es hoy Luther Northwestern Theological Seminary del ALC)., El Sínodo Noruego también abrió una escuela India en Wittenberg, la Bethany Indian Mission and Industral School, en 1884.