microscopia eletrônica (EM) é uma técnica para obter imagens de alta resolução de espécimes biológicos e não-biológicos. É usado em pesquisas biomédicas para investigar a estrutura detalhada de tecidos, células, organelas e complexos macromoleculares. A alta resolução das imagens EM resulta do uso de elétrons (que têm comprimentos de onda muito curtos) como fonte de radiação iluminante. Microscopia eletrônica é usada em conjunto com uma variedade de técnicas auxiliares (e.g., corte fino,rotulagem imunológica, coloração negativa) para responder a perguntas específicas. As imagens EM fornecem informações fundamentais sobre a base estrutural da função celular e da doença celular.

Existem dois tipos principais de microscópio electrónico – a em de transmissão (Met) e a em de varrimento (mee). O microscópio eletrônico de transmissão é usado para ver espécimes finos (seções de tecido, moléculas, etc) através dos quais os elétrons podem passar gerando uma imagem de projeção. O MET é análogo de muitas maneiras ao microscópio de luz convencional (composto)., O MET é utilizado, entre outras coisas, para a imagem do interior das células (em seções finas), a estrutura das moléculas proteicas (contrastadas por sombras metálicas), a organização de moléculas em vírus e filamentos citoesqueléticos (preparados pela técnica de coloração negativa), e o arranjo de moléculas proteicas em membranas celulares (por freeze-fratura).

microscopia electrónica de varrimento convencional depende da emissão de electrões secundários da superfície de uma amostra., Devido à sua grande profundidade de foco, um microscópio eletrônico de varredura é o análogo EM de um microscópio de luz estéreo. Ele fornece imagens detalhadas das superfícies de células e organismos inteiros que não são possíveis por met. Ele também pode ser usado para contagem de partículas e determinação de tamanho, e para controle de processo. É chamado de microscópio eletrônico de varredura porque a imagem é formada por varredura de um feixe de elétrons focados na superfície do espécime em um padrão raster., A interação do feixe de elétrons primário com os átomos próximos à superfície causa a emissão de partículas em cada ponto da raster (por exemplo, elétrons secundários de baixa energia, elétrons de alta energia dispersam elétrons, raios-X e até mesmo fótons). Estes podem ser coletados com uma variedade de detectores, e seu número relativo traduzido para brilho em cada ponto equivalente em um tubo de raios catódicos. Como o tamanho do raster no espécime é muito menor do que a tela de visualização do CRT, a imagem final é uma imagem ampliada do espécime., O Ses devidamente equipado (com detectores secundários, de retrospecção e de raios-X) pode ser utilizado para estudar a topografia e a composição atómica dos espécimes, bem como, por exemplo, a distribuição superficial de rótulos imunológicos.